В университете функционируют профсоюзные организации сотрудников и студентов. История их деятельности неразрывна с историей развития вуза. 

Основные задачи профсоюзной организации сотрудников отражены в ее Уставе и включают: защиту прав членов коллектива, оказание им социальной помощи, контроль соблюдения норм охраны труда, организацию трудовой деятельности коллектива совместно с руководством вуза, проведение культурно-массовых, спортивных, образовательных и других мероприятий.

В становлении профсоюзной организации сотрудников, после перевода института из Ленинграда в Воронеж, приняли участие председатели профкома: старший преподаватель М.И. Кирьянов (1960 – 1964 гг.) и доцент И.А. Марченко (1964 – 1968 гг.). В это время численность членов профсоюза не превышала 260 человек.

В последующие годы руководителями профорганизации технологического института были С.С. Шаденков (1968 – 1980 гг.), доцент В.И. Степыгин (1980 – 1984 гг.), В.М. Бугаков (1984 – 1985 гг.),  профессор Г.В. Попов (1985 - 2008 г.г), доцент С.А. Толстов (2008-2009 гг.), с 2009 г. по настоящее время – доцент Г.Н. Струков.

По мере развития института количество членов профсоюза неуклонно возрастало и к середине 80-х годов достигло более 900 человек. Профком ежегодно заключает с администрацией вуза Соглашение по охране труда, в котором фиксируются обязательства по устранению недостатков в охране труда работников  и мероприятия по улучшению условий труда. Практически решались ирешаются все задачи, закрепленные Уставом профсоюза. 

Большую работу профорганизация проводила по организации социалистического соревнования во всех подразделениях института.

Политические и социально-экономические процессы, происходившие в стране в начале 90-х годов, оказали существенное влияние на профсоюзное движение. В этих условиях профсоюзы искали свое место и роль в общественной жизни. На общем собрании 30 августа 1991 года, после запрета деятельности ряда общественных организаций Указом Президента РСФСР от 23 августа 1991 года, коллектив ВТИ единогласно проголосовал за сохранение профсоюза. В этот период деятельность профорганизации осложняется экономическими трудностями, деидеологизацией общества, переоценкой ценностей, падением роли общественных организаций. Несмотря на все это, в коллективе института не было массового выхода из профсоюза.

С этого времени профком взял курс на координацию коллективных действий вузовских профсоюзов Воронежской области. В апреле 1991 года на базе профорганизации ВТИ проводится первая межвузовская конференция по вопросам социально-правовой защиты работников высших учебных заведений. В эти годы профсоюзы начинают освобождаться от несвойственных им функций. Центр деятельности переносится на защиту законных интересов членов профсоюза. Начиная с 1992 года, профком составляет и заключает с администрацией института (академии) коллективный договор, призванный защищать права и интересы сотрудников вуза. Одним из приоритетных направлений в деятельности профкома на многие годы стали контроль за эффективностью использования средств государственного Фонда социального страхования Российской Федерации и привлечение дополнительных средств из федерального и регионального бюджетов на реализацию социальных программ.

Несмотря на трудности общественного развития страны, профорганизация сотрудников не утратила своего места и роли в жизни коллектива вуза. Ее численность сохранилась на уровне 90-х годов. Она объединяет 95,3 % всех работающих в вузе. В ее составе 10 первичных организаций и 72 профгруппы.